Suara yang berasal dari Shinkansen Hitam, “Phantom Shinkalion”, adalah milik Ina yang hilang. Taisei sangat terkejut hingga Aptitude Value-nya turun dan dia tidak bisa lagi mengendarai Shinkalion.
Sementara Akane, Ryota, Ten, dan Shion pergi ke berbagai tempat untuk mengalahkan para Unknowns yang muncul di seluruh negeri, Taisei, yang Aptitude Value-nya belum pulih, terjebak di dalam Metaverse.
Kemudian, seseorang muncul di hadapannya.
